Cantitate/Preț
Produs
Total produse
Vezi coșul
Algorithms in Bioinformatics: 8th International Workshop, WABI 2008, Karlsruhe, Germany, September 15-19, 2008, Proceedings de Keith Crandall

Algorithms in Bioinformatics: 8th International Workshop, WABI 2008, Karlsruhe, Germany, September 15-19, 2008, Proceedings: Lecture Notes in Computer Science, cartea 5251

Editat de Keith Crandall, Jens Lagergren
en Limba Engleză Paperback – 10 sep 2008

Actualizarea adusă de ediția a 8-a a workshopului WABI reflectă maturizarea domeniului bioinformaticii prin trecerea de la modele teoretice la soluții computaționale aplicate pe date experimentale masive. Observăm o orientare clară către optimizarea proceselor de asamblare a secvențelor și maparea genomului, reflectând nevoile tehnologice ale anului 2008. Reținem faptul că acest volum, parte din seria Lecture Notes in Bioinformatics, reușește să sintetizeze cercetări de vârf care utilizează instrumente matematice riguroase pentru a rezolva dileme biologice concrete.

Structura volumului este organizată progresiv, începând cu probleme fundamentale de rearanjare genomică (precum medianele multicromozomiale) și avansând către tehnici specifice de reconstrucție a transcriptomului și măsuri de calitate pentru micro-rețele (microarray). Cuprinsul indică o abordare tehnică diversă, incluzând metode Branch-and-Bound, programare liniară întreagă și scheme de aproximare în timp polinomial. Dacă Algorithms for Computational Biology de Adrian-Horia Dediu v-a oferit cadrul teoretic și fundamentele analizei de secvențe, această carte oferă instrumentele practice și studiile de caz necesare pentru implementarea algoritmilor în scenarii de cercetare reală.

Editată sub coordonarea lui Keith Crandall și Jens Lagergren, lucrarea publicată de Springer Berlin, Heidelberg servește drept resursă tehnică pentru dezvoltatorii de software bioinformatic. Credem că valoarea acestor proceduri rezidă în capacitatea lor de a transforma probleme biologice complexe în modele computaționale rezolvabile, oferind algoritmi rapizi pentru distanțele Robinson-Foulds sau co-plierea ARN-ului, elemente esențiale pentru înțelegerea evoluției și funcției moleculare.

Citește tot Restrânge

Din seria Lecture Notes in Computer Science

Preț: 57188 lei

Preț vechi: 71485 lei
-20%

Puncte Express: 858

Carte disponibilă

Livrare economică 03-17 iunie

 Adaugă în coș

Wish list
Gift list
Am citit!
Adaugă în listă

Specificații

ISBN-13: 9783540873600
ISBN-10: 3540873600
Pagini: 396
Ilustrații: XIII, 396 p.
Dimensiuni: 155 x 235 x 17 mm
Greutate: 0.59 kg
Ediția:2008
Editura: Springer Berlin, Heidelberg
Colecția Springer
Seriile Lecture Notes in Computer Science, Lecture Notes in Bioinformatics

Locul publicării:Berlin, Heidelberg, Germany

Public țintă

Research

De ce să citești această carte

Recomandăm acest volum cercetătorilor și dezvoltatorilor care doresc să stăpânească algoritmii avansați utilizați în analiza genomică și filogenetică. Cititorul câștigă acces la metodologii demonstrate pentru optimizarea asamblării secvențelor și modelare moleculară, fiind o resursă indispensabilă pentru cei care lucrează la intersecția dintre informatică și biologia moleculară, oferind soluții concrete pentru probleme de optimizare dificile.

Cuprins

Multichromosomal Genome Median and Halving Problems.- A Branch-and-Bound Method for the Multichromosomal Reversal Median Problem.- Decompositions of Multiple Breakpoint Graphs and Rapid Exact Solutions to the Median Problem.- Read Mapping Algorithms for Single Molecule Sequencing Data.- Exact Transcriptome Reconstruction from Short Sequence Reads.- Post-Hybridization Quality Measures for Oligos in Genome-Wide Microarray Experiments.- NAPX: A Polynomial Time Approximation Scheme for the Noah’s Ark Problem.- Minimum Common String Partition Parameterized.- Hardness and Approximability of the Inverse Scope Problem.- Rapid Neighbour-Joining.- Efficiently Computing Arbitrarily-Sized Robinson-Foulds Distance Matrices.- Efficient Genome Wide Tagging by Reduction to SAT.- Computing the Minimal Tiling Path from a Physical Map by Integer Linear Programming.- An Efficient Lagrangian Relaxation for the Contact Map Overlap Problem.- A Faster Algorithm for RNA Co-folding.- An Automated Combination of Kernels for Predicting Protein Subcellular Localization.- Fast Target Set Reduction for Large-Scale Protein Function Prediction: A Multi-class Multi-label Machine Learning Approach.- Multiple Instance Learning Allows MHC Class II Epitope Predictions Across Alleles.- An Algorithm for Orienting Graphs Based on Cause-Effect Pairs and Its Applications to Orienting Protein Networks.- Enumerating Precursor Sets of Target Metabolites in a Metabolic Network.- Boosting the Performance of Inference Algorithms for Transcriptional Regulatory Networks Using a Phylogenetic Approach.- Fast Bayesian Haplotype Inference Via Context Tree Weighting.- Genotype Sequence Segmentation: Handling Constraints and Noise.- Constructing Phylogenetic Supernetworks from Quartets.- Summarizing Multiple Gene TreesUsing Cluster Networks.- Fast and Adaptive Variable Order Markov Chain Construction.- Computing Alignment Seed Sensitivity with Probabilistic Arithmetic Automata.- The Relation between Indel Length and Functional Divergence: A Formal Study.- Detecting Repeat Families in Incompletely Sequenced Genomes.- Novel Phylogenetic Network Inference by Combining Maximum Likelihood and Hidden Markov Models.- A Local Move Set for Protein Folding in Triangular Lattice Models.- Protein Decoy Generation Using Branch and Bound with Efficient Bounding.

Textul de pe ultima copertă

This book constitutes the refereed proceedings of the 8th International Workshop on Algorithms in Bioinformatics, WABI 2008, held in Karlsruhe, Germany, in September 2008 as part of the ALGO 2008 meeting.
The 32 revised full papers presented together with the abstract of a keynote talk were carefully reviewed and selected from 81 submissions. All current issues of algorithms in bioinformatics are addressed, reaching from mathematical tools to experimental studies of approximation algorithms and reports on significant computational analyses. The topics range in biological applicability from genome mapping, to sequence assembly, to microarray quality, to phylogenetic inference, to molecular modeling.