Cantitate/Preț
Produs

Python for Biologists

Autor Dr Martin Jones
en Limba Engleză Paperback

Actualizarea perspectivei asupra cercetării moderne impune stăpânirea unor instrumente computaționale solide, iar Python for Biologists reprezintă fundamentul necesar pentru orice om de știință care dorește să depășească limitările procesării manuale a datelor. Observăm cum autorul, Dr Martin Jones, își folosește expertiza de lector în Bioinformatică pentru a transforma un limbaj de programare complex într-o unealtă de lucru accesibilă. Această lucrare rafinează abordarea didactică începută în Python for Complete Beginners, adaptând conceptele fundamentale de programare la nevoile specifice ale laboratorului de biologie.

Structura cursului este riguros organizată, pornind de la configurarea mediului de dezvoltare și ajungând la automatizarea unor sarcini complexe. Ne-a atras atenția focalizarea pe exerciții practice care oglindesc fluxul real de lucru într-un proiect de bioinformatică: de la manipularea secvențelor de ADN și proteine în capitolul doi, până la lucrul cu formate standard precum FASTA. Descoperim aici o metodologie progresivă prin care cititorul învață să scrie propriile funcții pentru analiza compoziției aminoacizilor sau să utilizeze expresii regulate pentru identificarea motivelor în secvențe genomice. Pe linia practică a volumului Managing Your Biological Data with Python, dar cu un focus mai accentuat pe rezolvarea problemelor de bioinformatică prin scripturi personalizate, cartea elimină bariera tehnică dintre cercetător și seturile mari de date.

Spre deosebire de alte manuale tehnice, Python for Biologists nu se rezumă la teorie, ci insistă pe bunele practici de testare și documentare a codului, asigurându-se că programele create sunt robuste și pot fi utilizate de întreaga comunitate științifică. Este o resursă care transformă programarea dintr-o abilitate opțională într-un avantaj competitiv în cariera academică.

Citește tot Restrânge

Preț: 21885 lei

Preț vechi: 27356 lei
-20%

Puncte Express: 328

Carte disponibilă

Livrare economică 05-19 mai


Specificații

ISBN-13: 9781492346135
ISBN-10: 1492346136
Pagini: 244
Dimensiuni: 189 x 246 x 13 mm
Greutate: 0.44 kg
Editura: CreateSpace Independent Publishing Platform

De ce să citești această carte

Recomandăm această carte biologilor și cercetătorilor care doresc să automatizeze analiza datelor genomice fără a avea cunoștințe prealabile de informatică. Prin parcurgerea exercițiilor de tăiere a intronilor sau filtrare a genelor, cititorul câștigă independență tehnică și capacitatea de a gestiona seturi de date masive, esențiale în bioinformatica modernă. Este un curs complet care transformă un începător într-un utilizator competent de Python.


Descriere scurtă

Learning to program is one of the best investments that you can make for your research and your career. Python for biologists is a complete programming course for beginners that will give you the skills you need to tackle common biological and bioinformatics problems. Why learn programming? Maybe you see colleagues writing programs to save time and deal with large datasets. Maybe your supervisor has told you that you need to learn programming for your next project. Maybe you've been looking at job ads and noticed just how many of them are asking for programming skills. Table of contents In chapter one, you'll learn why Python is a good choice for biologists and beginners alike. You'll also learn how to install Python for your operating system and how to set up your programming environment, complete with links to all the free software you'll need. In chapter two, you'll learn how to manipulate text (including DNA and protein sequences) and how to fix errors in your programs. Exercises: calculating AT content, splicing introns. In chapter three, you'll learn how to read and write data to and from files. You'll also learn how to deal with file paths and the FASTA file format.Exercises: splitting genomic DNA, writing a FASTA file. In chapter four, you'll learn how to process many pieces of data in a single program and more advanced tools for sequence manipulation. Exercises: trimming adapter sequences, concatenating exons. In chapter five, you'll learn how to make Python even more useful by creating your own functions, including the best ways to test those functions in order to speed up development. Exercises: Analyzing the amino acid composition of protein sequences. In chapter six, you'll learn how to write programs that can make smart decisions about how to handle data and how to make your programs follow complex rules. Exercises: filtering genes based on multiple criteria. In chapter seven, you'll learn an incredibly powerful tool for working with patterns in text - regular expressions - and how to use it to search in DNA and protein sequences. Exercises: filtering accession names and calculating restriction fragment sizes. In chapter eight, you'll learn how to store huge amounts of data in a way that can still allows it to be retrived very efficiently. This allows simplification of much of the code from previous chapters. Exercises: translating DNA sequences to protein. In chapter nine, you'll learn how to make your Python programs work in harmony with existing tools, and how to polish up your programs so that they're ready for other people to use. Exercises: counting k-mers, binning DNA sequences by length. About the author Dr. Martin Jones has been teaching biologists to write software for over five years and has taught everyone from postgraduates to PIs. He is currently Lecturer in Bioinformatics at Edinburgh University.