Cantitate/Preț
Produs

Insect Genomics: Methods and Protocols: Methods in Molecular Biology, cartea 1858

Editat de Susan J. Brown, Michael E. Pfrender
en Limba Engleză Hardback – 10 noi 2018

Structura acestui volum este riguros segmentată pentru a oglindi etapele critice ale cercetării genomice moderne: de la izolarea materialului genetic și estimarea dimensiunii genomului prin citometrie în flux, până la asamblarea secvențelor de tip „long-read” și adnotarea funcțională a regiunilor reglatoare. Reținem că Insect Genomics nu se limitează doar la secvențiere, ci alocă spații ample analizei epigenetice prin bisulfit și identificării promotorilor folosind tehnici precum RAMPAGE, oferind o perspectivă clinică asupra arhitecturii genetice a artropodelor.

În contextul operei editorilor, deși Susan J. Brown apare asociată în baze de date cu lucrări de nișă precum Jane Austen Junkie, contribuția sa în acest volum este pur tehnică și academică, ancorată în rigoarea seriei Methods in Molecular Biology. Credem că volumul reușește să sintetizeze complexitatea bioinformatică necesară pentru asamblarea genomurilor non-model, oferind soluții practice pentru controlul calității prin instrumente precum BUSCO sau GFF3toolkit.

Alternativă la Protocols for Cytogenetic Mapping of Arthropod Genomes pentru cercetătorii care au nevoie de o abordare axată pe secvențiere și bioinformatică, Insect Genomics se diferențiază prin accentul pus pe metodele de generație nouă (NGS) și pe integrarea datelor de reglementare cis. În timp ce lucrarea lui Igor V. Sharakhov se concentrează pe maparea fizică cromozomială, volumul de față extinde analiza către modificări epigenetice și strategii de design RNAi, fiind mult mai relevant pentru laboratoarele axate pe genomică funcțională. Merită menționat că fiecare capitol respectă formatul consacrat al seriei, incluzând liste de reactivi și secțiuni esențiale de depanare (troubleshooting), vitale pentru reproductibilitatea experimentelor.

Citește tot Restrânge

Din seria Methods in Molecular Biology

Preț: 106090 lei

Preț vechi: 111674 lei
-5%

Puncte Express: 1591

Carte tipărită la comandă

Livrare economică 21 mai-04 iunie


Specificații

ISBN-13: 9781493987740
ISBN-10: 1493987747
Pagini: 290
Ilustrații: XI, 237 p. 34 illus., 23 illus. in color.
Dimensiuni: 178 x 254 x 16 mm
Greutate: 0.65 kg
Ediția:1st ed. 2019
Editura: Springer
Colecția Humana
Seria Methods in Molecular Biology

Locul publicării:New York, NY, United States

De ce să citești această carte

Această resursă este esențială pentru doctoranzii și cercetătorii din genetică și entomologie care doresc să stăpânească fluxurile de lucru bioinformatice moderne. Cititorul câștigă acces la protocoale verificate pentru asamblarea genomurilor complexe și analiza regiunilor reglatoare, beneficiind de sfaturi practice pentru evitarea erorilor comune în laborator. Este un ghid tehnic indispensabil pentru implementarea strategiilor de RNAi și studiul endosimbionților prin TEEseq.


Descriere scurtă

This volume focuses on the latest methods used to sequence, assemble, and analyze insect genomes. The collection of protocols in this book provides an introduction to the workflows and bioinformatics tools available for researchers. The chapters cover a range of useful topics such as determining genome size by flow cytometry; High Molecular Weight DNA extraction; improvements to a genome assembly provided by long-range sequencing approaches; assessments of orthology and single-copy genes at different phylogenetic levels; detecting regulatory regions with FAIRE, RAMPAGE, and computational analysis of cis-regulatory modules in insects; bioinformatics analysis of epigenetic modifications, high-throughput scanning of insect genomes (TEEseq) for the presence of endosymbionts, and leveraging genome sequence information to design RNAi strategies. Written in the highly successful Methods in Molecular Biology series format, chapters include introductions to their respectivetopics, lists of the necessary materials and reagents, step-by-step, readily reproducible laboratory protocols, and tips on troubleshooting and avoiding known pitfalls.

Cutting-edge and thorough, Insect Genomics: Methods and Protocols is a valuable resource for graduate students, postdocs, and novice research scientists who are interested in learning more about this developing field.

Cuprins

Arthropod Genome Sequencing and Assembly Strategies.- Genome Size Estimation and Quantitative Cytogenetics in Insects.- Isolation of HMW DNA from Insects Chapter.- Long range sequencing and assembly QC.- Integrated modeling of structural genes using MCuNovo.- Using BUSCO to Assess Insect Genomic Resources.- The GFF3toolkit—QC and Merge Pipeline for Genome Annotation.- Using Formaldehyde-Assisted Isolation of Regulatory Elements (FAIRE) to identify functional regulatory DNA in insect genomes.- Using RAMPAGE to identify and annotate promoters in insect genomes.- CRM Beyond Model Insects.- Whole-genome bisulfite sequencing for the methylation analysis of insect genomes.- Bioinformatic analysis of methylation patterns using bisulfite sequencing data.- Physical Genome Mapping Using Fluorescence in Situ Hybridization with Mosquito Chromosomes.- Target enriched RAD sequencing (TEEseq): A new high-throughput sequencing approach applied to the comprehensive characterization of endosymbionts.

Caracteristici

Includes cutting-edge techniques for the study of insect genomics Provides step-by-step detail essential for reproducible results Contains key implementation advice from the experts