Cantitate/Preț
Produs

Data Analytics for Protein Crystallization: Computational Biology, cartea 25

Autor Marc L. Pusey, Ramazan Sava¿ Aygün
en Limba Engleză Hardback – 13 dec 2017

Notăm cu interes apariția volumului Data Analytics for Protein Crystallization, o lucrare care se încadrează în nucleul dur al biologiei computaționale și structurale, fiind esențială pentru cercetătorii care doresc să automatizeze procesele de laborator. Într-un context academic în care volumul de date experimentale depășește capacitatea de analiză manuală, această primă ediție propune o trecere riguroasă de la tehnicile tradiționale la sistemele robotizate de tip high-throughput. Cartea extinde cadrul metodologic propus de Protein Crystallography de Alexander Wlodawer, care se concentrează pe protocoale de laborator, aducând în prim-plan componenta de analiză digitală și viziune artificială necesară pentru interpretarea imaginilor de cristalizare. Reținem organizarea logică a conținutului, care urmărește progresia firească a unui experiment: de la bazele cristalizării proteinelor și achiziția robotică a imaginilor, până la tehnici avansate de segmentare a regiunilor cristaline și vizualizare. Un aspect distinctiv față de lucrări precum Crystallization of Nucleic Acids and Proteins de Arnaud Ducruix este accentul pus pe algoritmi: autorii Marc L. Pusey și Ramazan Savaș Aygün detaliază metode de focal stacking pentru a corecta aberațiile optice și tehnici de binarizare prin praguri (thresholding). Structura cărții permite atât o introducere în domeniu, cât și o aprofundare a provocărilor viitoare în cristalizarea computațională, oferind soluții pentru gestionarea seriilor temporale de imagini și clasificarea automată a fazelor de cristalizare. Este o resursă care transformă cristalografia dintr-o artă experimentală într-o disciplină bazată pe date precise.

Citește tot Restrânge

Din seria Computational Biology

Preț: 62419 lei

Preț vechi: 73433 lei
-15%

Puncte Express: 936

Carte disponibilă

Livrare economică 22 mai-05 iunie


Specificații

ISBN-13: 9783319589367
ISBN-10: 3319589369
Pagini: 252
Ilustrații: XX, 231 p. 66 illus., 56 illus. in color.
Dimensiuni: 160 x 241 x 19 mm
Greutate: 0.59 kg
Ediția:1st edition 2017
Editura: Springer
Colecția Computational Biology
Seria Computational Biology

Locul publicării:Cham, Switzerland

De ce să citești această carte

Credem că această carte este indispensabilă pentru bioinformaticieni și specialiștii în biologie structurală care vor să implementeze sisteme automate de screening. Cititorul câștigă o înțelegere profundă a modului în care algoritmii de procesare a imaginii și analiza datelor pot reduce erorile umane în identificarea cristalelor proteice, oferind un avantaj competitiv în cercetarea fundamentală și farmaceutică.


Despre autor

Marc L. Pusey este un cercetător recunoscut în domeniul cristalizării proteinelor, contribuind semnificativ la dezvoltarea tehnologiilor de monitorizare a creșterii cristalelor. Ramazan Savaș Aygün este profesor asociat specializat în baze de date și sisteme multimedia, cu un accent deosebit pe analiza imaginilor științifice. Împreună, cei doi autori combină expertiza în biofizică cu rigoarea informatică, oferind o perspectivă interdisciplinară unică asupra automatizării în biologia structurală, reflectată în numeroasele lor colaborări de cercetare publicate în jurnale de profil.


Cuprins

Introduction to Protein Crystallization.- Scoring and Phases of Crystallization.- Computational Methods for Protein Crystallization Screening.- Robotic Image Acquisition.- Classification of Crystallization Trial Images.- Crystal Growth Analysis.- Focal Stacking for Crystallization Microscopy.- Crystal Image Region Segmentation.- Visualization.- Other Structure Determination Methods.- Future of Computational Protein Crystallization.

Notă biografică

Dr. Marc L. Pusey is a Research Scientist at iXpressGenes, Inc., Huntsville, AL, USA.

​Dr. Ramazan S. Aygün is an Associate Professor in the Computer Science Department of the University of Alabama in Huntsville, USA.

Textul de pe ultima copertă

This unique text/reference presents an overview of the computational aspects of protein crystallization, describing how to build robotic high-throughput and crystallization analysis systems. The coverage encompasses the complete data analysis cycle, including the set-up of screens by analyzing prior crystallization trials, the classification of crystallization trial images by effective feature extraction, the analysis of crystal growth in time series images, the segmentation of crystal regions in images, the application of focal stacking methods for crystallization images, and the visualization of trials.
Topics and features:

  • Describes the fundamentals of protein crystallization, and the scoring and categorization of crystallization image trials
  • Introduces a selection of computational methods for protein crystallization screening, and the hardware and software architecture for a basic high-throughput system
  • Presents an overview of the image features used in protein crystallization classification, and a spatio-temporal analysis of protein crystal growth
  • Examines focal stacking techniques to avoid blurred crystallization images, and different thresholding methods for binarization or segmentation
  • Discusses visualization methods and software for protein crystallization analysis, and reviews alternative methods to X-ray diffraction for obtaining structural information
  • Provides an overview of the current challenges and potential future trends in protein crystallization
This interdisciplinary work serves as an essential reference on the computational and data analytics components of protein crystallization for the structural biology community, in addition to computer scientists wishing to enter the field of protein crystallization.

Dr. Marc L. Pusey is a Research Scientist at iXpressGenes, Inc. Huntsville, AL, USA. Dr.Ramazan Savaş Aygün is an Associate Professor in the Computer Science Department of the University of Alabama in Huntsville, USA.


Caracteristici

Presents an overview of computational aspects of protein crystallization Reviews computational methods for protein crystallization screening Discusses the effective scoring of protein crystallization trial images Examines the image processing of crystallization trial images Describes the spatiotemporal analysis of protein crystal growth Includes supplementary material: sn.pub/extras