Cantitate/Preț
Produs

Ancient DNA: Methods and Protocols: Methods in Molecular Biology, cartea 840

Editat de Beth Shapiro, Michael Hofreiter
en Limba Engleză Hardback – 16 ian 2012

Considerăm volumul Ancient DNA, editat de Beth Shapiro și Michael Hofreiter, drept un instrument metodologic esențial care depășește abordările teoretice, concentrându-se pe rigoarea tehnică necesară în genetica evolutivă. Clinicienii și cercetătorii care utilizează Ancient DNA Typing de Susanne Hummel ca referință vor găsi în această lucrare din seria Methods in Molecular Biology un set mult mai diversificat de protocoale pentru substrate atipice, precum solurile, sedimentele sau materialul fixat în formalină. În timp ce manualul lui Hummel se axează pe antropologie și medicină legală, volumul de față extinde spectrul către biologia conservării și paleontologie.

Structura cărții urmărește o progresie logică, de la cerințele infrastructurii fizice — configurarea unui laborator aDNA pentru a preveni contaminarea — până la analizele bioinformatice complexe. Descoperim aici secțiuni dedicate extracției din țesuturi dure, dar și studii de caz fascinante care demonstrează aplicabilitatea metodelor pe specii dispărute. Față de abordările generale din PCR Protocols, tehnica descrisă de Beth Shapiro pune accent pe gestionarea fragmentelor scurte și degradate, specifice specimenelor de muzeu și fosilelor. Reținem integrarea metodelor de tip NGS (Next-Generation Sequencing), care permit procesarea volumelor mari de date genetice, o evoluție majoră față de primele secvențieri mitocondriale de acum un sfert de secol. Stilul este unul clinic și pragmatic, fiecare capitol incluzând liste de reactivi și secțiuni de depanare (troubleshooting) care anticipează obstacolele experimentale inerente acestui domeniu.

Citește tot Restrânge

Din seria Methods in Molecular Biology

Preț: 105846 lei

Preț vechi: 111417 lei
-5%

Puncte Express: 1588

Carte tipărită la comandă

Livrare economică 26 mai-09 iunie


Specificații

ISBN-13: 9781617795152
ISBN-10: 1617795151
Pagini: 214
Ilustrații: XII, 247 p. 26 illus., 12 illus. in color.
Dimensiuni: 178 x 254 x 15 mm
Greutate: 0.59 kg
Ediția:2012
Editura: Humana Press Inc.
Colecția Humana
Seria Methods in Molecular Biology

Locul publicării:Totowa, NJ, United States

Public țintă

Professional/practitioner

De ce să citești această carte

Această lucrare este indispensabilă cercetătorilor din genetica preclinică și arheogenetică. Oferă soluții practice pentru una dintre cele mai mari provocări ale domeniului: recuperarea informației genetice din probe extrem de degradate sau contaminate. Cititorul câștigă acces la protocoale verificate pentru substrate dificile (cheratină, chitină sau sol), asigurând reproductibilitatea experimentelor în orice laborator de biologie moleculară care studiază evoluția speciilor.


Despre autor

Beth Shapiro este profesor asociat de ecologie și biologie evolutivă la University of California, Santa Cruz, fiind o figură centrală în domeniul paleogeneticii. Distinsă cu prestigiosul MacArthur Award în 2009, activitatea sa de cercetare a fost publicată în reviste de referință precum „Nature” și „Science”. Spre deosebire de lucrarea sa de popularizare a științei, How to Clone a Mammoth, unde explorează posibilitatea teoretică și etică a de-extincției, în Ancient DNA Shapiro adoptă rolul de editor tehnic, oferind comunității științifice rigoarea metodologică necesară pentru a transforma speculațiile despre trecut în date genetice concrete.


Cuprins

Setting Up An Ancient DNA Laboratory.-A Phenol-Chloroform Protocol for Extracting DNA from Ancient Samples.-DNA Extraction of Ancient Animal Hard Tissue Samples via Adsorption to Silica Particles.-­­Case Study: Recovery of ancient nuclear DNA from Toe Pads of the Extinct Passenger Pigeon.-Extraction of DNA from Paleofeces.-DNA Extraction from Keratin and Chitin.-Case Study:  Ancient sloth DNA Recovered from Hairs Preserved in Paleofeces.-Ancient DNA Extraction from Soils and Sediments.-DNA Extraction from Fossil Eggshell.-Ancient DNA Extraction from Plants.-DNA Extraction from Formalin-fixed Material.-Case Study: Ancient DNA recovered from Pleistocene-age Remains of a Florida Armadillo.-Non-destructive DNA Extraction from Museum Specimens.-Case Study: Using a Non-destructive DNA Extraction Method to Generate mtDNA Sequences from Historical Chimpanzee Specimens .-PCR Amplification, Cloning and Sequencing of Ancient DNA.-Quantitative Real-time PCR in aDNA Research.-Multiplex PCR Amplification of Ancient DNA.-Preparation of Next-generation Sequencing Libraries from Damaged DNA.-Generating Barcoded Libraries for Multiplex High-throughput Sequencing.-Case Study: Targeted high-throughput Sequencing of Mitochondrial Genomes from Extinct Cave Bears via Direct Multiplex PCR Sequencing (DMPS).-Target Enrichment via DNA Hybridization Capture.-Case Study: Enrichment of Ancient Mitochondrial DNA by Hybridization Capture.-Analysis of High-throughput Ancient DNA Sequencing Data.-Phylogenetic Analysis of Ancient DNA using BEAST.

Textul de pe ultima copertă

Research into ancient DNA began more than 25 years ago with the publication of short mitochondrial DNA sequence fragments from the quagga, an extinct relative of the zebra. Ancient DNA research really gained momentum following the invention of PCR, which allowed millions of copies to be made of the few remaining DNA molecules preserved in fossils and museum specimens.  In Ancient DNA: Methods and Protocols expert researchers in the field describe many of the protocols that are now commonly used to study ancient DNA. These include instructions for setting up an ancient DNA laboratory, extraction protocols for a wide range of different substrates, details of laboratory techniques including PCR and NGS library preparation, and suggestions for appropriate analytical approaches to make sense of the sequences obtained. Written in the highly successful Methods in Molecular Biology™ series format, chapters include introductions to their respective topics, lists of the necessary materials and reagents, step-by-step, readily reproducible laboratory protocols, and key tips on troubleshooting and avoiding known pitfalls.
 
Authoritative and practical, Ancient DNA: Methods and Protocols seeks to aid scientists in the further study of ancient DNA and the methodological approaches in ancient research.

Caracteristici

Closes the gap between appropriate methodologicol approaches and retrieval and anysis of ancient DNA Provides step-by-step detail essential for reproducible results Contains key notes and implementation advice from the experts