De nombreuses especes montrent des variations cycliques de leurs densites. Ces cycles ont un role important dans l'emergence de zoonoses en augmentant les contacts entre l'Homme et l'animal. Suivant une approche d'ecologie de la sante, j'ai etudie la communaute de parasites d'une communaute de rongeurs a dynamique cyclique afin d'identifier les reservoirs d'agents de zoonoses et les parasites potentiellement impliques dans les cycles de cette communaute. Les resultats et les suivis epizootiologiques realises en Franche-Comte permettent d'inferer les facteurs de risques biotiques et abiotiques associes a l'emergence de ces zoonoses. Trois agents de zoonoses sont presents: deux hantavirus et le virus Cowpox. La dispersion et le comportement social des rongeurs sont importants pour la transmission de ces virus."