El argumento desarrolla el caso de un hombre que vive un amor dramatico, relacionado con episodios de la guerra civil. Se ha dicho que esta obra contiene muchos trozos enteramente autobiograficos, y que Altamirano paso por algun trance intimo semejante al que describe en el protagonista de Clemencia. La historia comienza presentandonos a dos mujeres, Clemencia (morena) e Isabel (rubia), opuestas las dos en caracter como lo son fisicamente.