L'analyse des sequences des genes de l'ADNr nucleaire, et plus particulierement des regions ITS, pour evaluer la variabilite interspecifique et intra specifique n'est pas efficace dans le cas des especes tres proches pour cela on a utilise le gene Tef1 puisqu'il est plus variable. Les ITS- RFLP a donne une diversite plus importante avec l'enzyme de restriction HaeIII qu'avec l'enzyme RsaI, on a obtenu 6 groupes phylogeniques avec RsaI et 10 groupes phylogeniques avec HaeIII. Pour l'identification des isolats on a amplifie le gene tef1 puis le produit ont ete purifie et ensuite sequence. Les sequences obtenues ont ete comparees par alignement avec les sequences des autres especes de Trichoderma qui se trouve dans les banques de sequences. Les especes identifiees sont T. harzianum/inhamatum (T. inhamatum, et T. citrinoviride. Le pouvoir antagoniste des Trichoderma a ete etudie en co-culture avec des agents pathogenes. La presence d'une zone d'inhibition au point de contact entre les deux protagonistes a ete notee. Lors de ces tests in vitro, il apparait que Trichoderma a une bonne activite antagoniste contre les champignons pathogenes."