Les methodes RMN appliquees a l'etude structurale des proteines sont basees sur la mesure d'informations geometriques locales entre protons. Le manque de contraintes a longue portee est un facteur limitant pour l'etude des proteines de grande taille. La deuteration de ces systemes est necessaire pour leurs etudes. Neanmoins, le remplacement des protons par du deuterium limite le nombre de contraintes structurales observables. Pour resoudre ce probleme, une strategie basee sur la protonation specifique des methyles a ete mise en place, ils constituent un choix optimal pour l'obtention de contraintes a longue portee. Les protocoles de marquage specifique des methyles des Isoleucines, des Valines et des Leucines ont ete optimises, et une nouvelle methode de protonation specifique des Alanines a ete developpee. Dans des systemes de taille moderee, l'utilisation de ce type de marquage combine aux developpements d'experiences RMN adaptees permet la detection de contraintes entre paire de methyles separes par plus de 12A. Cette approche s'applique egalement a des proteines de grande taille, ainsi des NOEs entre methyles distants par plus de 7A sont detectes dans un systeme de 468kDa"